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化学修饰的热启动DNA聚合酶,在室温时酶活力被完全抑制,避免非特异性扩增。95oC加热数分钟后抑制失效,Taq酶恢复活力。
SYBR Green I游离状态下几乎无荧光,与双链DNA非特异性结合后产生很强的荧光。反应体系中SYBR Green I的荧光强度,与双链DNA的含量成正比,因此可用于目的基因的定量。
DNA扩增呈指数增长,在反应体系和条件完全一致的情况下,样本DNA含量与扩增产物的对数成正比,由于反应体系中的荧光染料或荧光探针与扩增产物结合发光,其荧光量与扩增产物量成正比,因此通过荧光量的检测就可以测定样本核酸量。
| 染料法 | 探针法 | |
|---|---|---|
| 优点 | • 价格便宜 • 适用性广 • 可借助熔解曲线或凝胶分析产物特异性 |
• 特异性好 • 灵敏度高,适合低丰度基因定量 |
| 缺点 | • 特异性稍差 • 引物要求高 |
• 价格贵 • 只适合特定目标 |
| 应用 | 科研中多个基因定量分析,表达量研究等 | 病原体检测,疾病耐药基因研究,药物疗效分析,遗传疾病诊断 |
*本产品使用的为染料法。
HBStart Green qPCR Premix包含化学修饰的热启动DNA聚合酶、缓冲液、SYBR Green I荧光染料、dNTP、稳定剂等,预混成2X Premix,使用时只需加入模板、引物和水,即可进行qPCR检测。
化学修饰的热启动DNA聚合酶,在室温时酶活力被完全抑制,避免非特异性扩增。95℃加热数分钟后抑制失效,Taq酶恢复活力。
SYBR Green I游离状态下几乎无荧光,与双链DNA非特异性结合后产生很强的荧光。反应体系中SYBR Green I的荧光强度,与双链DNA的含量成正比,因此可用于目的基因的定量。
| 试剂 | 使用量 |
|---|---|
| HBStart Green qPCR Premix | 5 μL |
| 正向引物(10 μM) | 0.4 μL |
| 反向引物(10 μM) | 0.4 μL |
| DNA 模板 | X μL(推荐 1~2 μL) |
| Nuclease-Free Water | 补足至10 μL |
两步法
| 步骤 | 温度 | 时间 |
|---|---|---|
| 预变性 | 95℃ | 30sec |
| 变性 | 95℃ | 10sec |
| 退火&延伸 | 60℃ | 30sec (40 Cycles) |
| 熔解曲线 | 使用仪器默认采集程序 | |
三步法
| 步骤 | 温度 | 时间 |
|---|---|---|
| 预变性 | 95℃ | 30sec |
| 变性 | 95℃ | 10sec |
| 退火 | 55~65℃ | 10sec (40 Cycles) |
| 延伸 | 72℃ | 30sec |
| 熔解曲线 | 使用仪器默认采集程序 | |
| 问题描述 | 可能原因 | 解决办法 |
|---|---|---|
| 扩增曲线不光滑 | 荧光信号太弱,经系统校正后产生 | 确保Mix中预混的染料未降解;更换荧光信号收集更好的qPCR专用耗材 |
| 扩增曲线断裂或下滑 | 模板浓度较高,基线的终点值大于Cq值 | 减小基线终点(Cq值-4),重新分析数据 |
| 个别孔扩增曲线突然骤降 | 反应管内留有气泡 | 确保Mix完全溶解,请勿涡旋振荡混匀 加样完成后轻弹离心去除气泡 延长预变性时间至10min,以去除气泡 |
| 反应结束无扩增曲线出现 | 反应循环数偏少 | 设置循环数为40,但更多的循环数会增加过多的背景信号 |
| 荧光信号采集步骤未设置或者设置错误 | 两步法扩增程序一般将信号采集设置在退火&延伸阶段,三步法扩增程序应当将信号采集设置在72℃延伸阶段 | |
| 引物可能降解 | 长期未用的引物,应先通过PAGE电泳检测完整性,以排除其降解的可能 | |
| 模板浓度过低 | 减少模板稀释倍数重复实验,样品浓度未知的情况下先从最高浓度做起 | |
| 模板降解 | 重新制备模板,重复实验 | |
| Cq值出现过晚 | 扩增效率低 | 提高引物浓度,尝试三步法扩增程序,或者重新设计引物 |
| 模板浓度过低 | 减少模板稀释倍数重复实验,样品浓度未知的情况下先从最高浓度做起 | |
| 模板降解 | 重新制备模板,重复实验 | |
| 扩增产物过长 | 扩增产物长度控制在80~200bp | |
| 体系中存在PCR抑制剂 | 一般为模板带入,加大模板稀释倍数或重新制备纯度高的模板重复实验 | |
| 空白对照出现信号 | 反应体系污染 | 首先更换空白对照的水,如果还发生同样情况,继续更换引物、吸头、PCR管或启用新的Mix;反应体系在超净工作台内配制,减少气溶胶污染 |
| 出现引物二聚体等非特异性扩增 | 一般在35循环以后空白对照出现扩增产物属正常情况,应配合熔解曲线进行分析;重新设计引物,调整引物浓度或优化PCR反应程序 | |
| 熔解曲线出现多峰 | 引物设计不佳 | 根据引物设计原则重新设计新引物 |
| 引物浓度过高 | 适当降低引物浓度 | |
| cDNA模板存在基因组污染 | 提取后的RNA溶液使用DNA酶进行消化,例如:dsDNase,以去除基因组污染,或设计跨内含子引物 | |
| 实验重复性差 | 加样误差大 | 使用精准的移液器、配合高品质吸头准确移液 高倍稀释模板,加入大体积模板减少加样误差 放大qPCR反应体积 |
| 模板浓度过低 | 减少模板稀释倍数重复实验 | |
| qPCR仪不同位置的温度偏差 | 定期校准qPCR仪 |
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